舰队编组的核心在于合理分配指挥值、优化舰船站位以及针对性调整技术值。一支舰队最多可容纳300指挥值的舰船，升级至九级基地后可提升至400指挥值。舰船站位分为前排、中排和后排，敌方会优先攻击前排，因此高防御舰船应置于前排吸收伤害，而输出型舰船则适合放在中后排。舰船站位由蓝图中的定位决定，无法手动调整，因此选择舰船时需提前考虑其定位是否符合编组需求。
舰船类型的选择直接影响舰队战斗力。前排推荐使用能抗能打的舰船，如奇美拉或艾奥级，它们兼具生存与输出能力；中排可选择高攻巡洋舰或驱逐舰，如红宝石或枪骑兵级；后排则适合部署航母或战列巡洋舰，提供远程火力支援。维修船在前期可辅助续航，但后期作用有限，建议替换为输出舰船以加快战斗节奏。移动速度也是关键属性，舰队整体速度由最慢的舰船决定，编组时需避免低速舰船拖累机动性。
技术值加点是提升舰船性能的重要手段。前排舰船应优先强化护甲和闪避，中后排则侧重火力与命中率。蓝图研究是获取技术值的主要途径，通过战斗或任务也能积累经验。编组完成后，可在蓝图界面微调加点，以适应不同作战任务。攻城战时可为舰船增加攻城伤害，而PVP对抗则可强化对舰火力。增援指令能临时补充5艘舰船，无视指挥值限制，适合在紧急情况下增强舰队实力。
舰队命名虽是小细节，却能发挥战术作用。自定义名称不仅便于管理，还能在PVP中迷惑对手，例如将主力舰队命名为侦查小队以降低敌方警惕性。编组完成后，需通过属性界面确认火力、速度等数据是否达标。出征前还可通过计划圈优化行动路径，减少不必要的移动时间。合理的编组策略能显著提升舰队效率，无论是资源采集还是大型战役，都能占据优势。
随着游戏进程推进，需逐步淘汰低级舰船，替换为高级型号，同时根据对手阵容灵活调整编组。对抗航母编队时，可加入防空特化舰船；面对高防敌人时，则需增加穿透型火力。持续优化编组策略，才能在浩瀚宇宙中立于不败之地。
