前往一之岛需要满足特定条件并完成系列任务。首先需确保已通关一周目，即击败关都地区8个道馆馆主和四天王成为冠军。随后前往真新镇与大木博士对话，若图鉴收集超过60种宝可梦，博士会协助升级全国图鉴模式。系统会提示科拿外出旅行，触发群岛剧情线。
获得前往群岛资格后，需前往枯叶市码头。在码头与船员对话会获得彩虹通行证，这是穿梭七岛的关键道具。持有通行证后返回枯叶市码头，找到停靠的渡轮海狮号并选择目的地为一之岛。航行过程会直接切入场景转换动画，角色将出现在一之岛码头。注意若未完成红宝石任务，渡轮可能不会开放全部航线。
登岛后首要任务是修复网络中心的通信设备。在一之岛网络中心与研究员对话，得知需要红宝石重启系统。前往灯火山洞穴深处击败火箭队残党并取得红宝石，将其交还给研究员后可解锁七岛间自由通行权限。此阶段需注意灯火山地形复杂，建议队伍中配备水系或地面系宝可梦应对火系敌人。
完成基础任务后，一之岛可探索区域包括火山温泉、宝贝屋等地点。火山温泉可恢复宝可梦状态，宝贝屋则提供特殊交换活动。若需返回关都地区，只需在码头再次乘坐海狮号选择枯叶市即可。二周目后期还需返回一之岛交付蓝宝石，因此建议提前熟悉岛屿布局。
整个流程需严格遵循任务链推进，遗漏关键步骤可能导致航线中断。群岛剧情是二周目核心内容之一，合理规划探索顺序能显著提升效率。
