神秘石块是解开多个关键谜题的核心道具之一。游戏开始时，玩家需要先在房间内临摹画板上的图案，随后与客厅的老奶奶对话获取关于信箱钥匙和时间机器的信息。在二楼探索时，务必记录黑板上的图案并获取日记中的信箱钥匙。屋外信箱中的船票是前往码头的重要物品，而灯塔的密码北南西东东北则是进入灯塔的关键。灯塔内部的三楼可以找到异形钥匙，用于打开电箱获取摇杆，这些步骤都与后续获取神秘石块密切相关。
工厂区域的解密环节是获取神秘石块的重要节点。进入工厂后，需解开大门密码机关，将红灯填满即可开启。工厂内左侧楼梯可拾取灯泡，屏幕下方的三角石1是时间机器的关键组件之一。在工厂右侧房间的石盘谜题中，需将绿色珠子挪到对应位置，完成后可获得鲁特琴。工厂内与外星人互动时，需留意其挥动小球留下的线索，这些线索往往与神秘石块的摆放或使用方式有关。记录墙上的光电图案对后续解谜有直接帮助。
回到灯塔二楼与戴围巾的男人对话，将空瓶子交给他后会获得漂流瓶。漂流瓶可在码头捡起，瓶中的图案需仔细记录。在船上底部鲸鱼处，使用工厂获得的刀剖开鲸鱼肚子，能获取鱼骨和矛头。返回公寓，在火炉旁使用锯刀获取鹿角，并在二楼日记最后一页用铅笔涂抹被撕掉的密码部分，可揭示时间机器的启动密码。将两块时间石块放入机器，根据工厂陈列室的线索和笔记本密码对照，即可激活时光机穿越到过去。
在过去的时间线中，神秘石块的应用更为关键。与公主身后的石门对话时，需使用蓝色石块打开石门，获取蓝珠子和石饼。完成拼图后获得绿色药水，用于后续复活工厂中的外星人。返回现在时间线后，需在长廊尽头完成游戏进入石室，与男人对话获取曼陀罗花并麻醉蜣螂，记录其背上花纹。再次穿越到过去时，这些花纹可用于打开石室大门，揭示与巨型雕像相关的秘密。最终在火箭发射阶段，需将金色石块放入神庙一楼，通过石像眼睛对应的方向获取蓝色能量块，完成飞船的能量供给。
神秘石块的收集和使用贯穿游戏多个核心环节，每一步骤都需结合场景中的其他线索进行综合推理。从灯塔到工厂，再到时间穿越和神庙解密，玩家需保持对细节的观察，并合理运用已获得的道具。游戏中的谜题设计具有逻辑连贯性，前期的线索往往在后期发挥关键作用，因此建议玩家在探索过程中养成记录信息的习惯。
